Početak / Zavod / Ustrojstvo / Služba za mikrobiologiju / Pravila uzimanja uzorka kliničkog materijala za mikrobiološku pretragu  

SLUŽBA ZA
MIKROBIOLOGIJU


Informacije

Za Službu:
Rockefellerova br. 12
  tel. (+385 1) 48 63 236
hzzjz-virologija@zg.t-com.hr
 


Popis djelatnika


Opća pravila za uzimanje uzoraka
Laboratoriji - kontakt telefoni
Primanje pacijenata i uzoraka / izdavanje nalaza
 
Upute za uzimanje i slanje uzoraka
 

Literatura:
1. Murray. Clinical Microbiology, 8th edition
2. Master RN.Mycobacteriology. In: Isenberg HD (ed).Clinical microbiology procedures handbook. Washington:American Society for Microbiology,1992

 

 
   
  POPIS MIKROBIOLOŠKIH PRETRAGA


BAKTERIOŠKE PRETRAGE

-     Metode izravne bakteriološke dijagnostike

-     Metode neizravne bakteriološke dijagnostike - SEROLOŠKE PRETRAGE - za dokaz protutijela na bakterijske antigene u serumu bolesnika

-     Serološke pretrage za dokaz reumatoidnih stanja i autoimunih bolesti

 

VIROLOŠKE PRETRAGE

-     Metode izravne virološke dijagnostike

-     Metode neizravne virološke dijagnostike - SEROLOŠKE PRETRAGE - za dokaz protutijela  na virusne antigene u serumu bolesnika

 

PARAZITOLOŠKE PRETRAGE

-     Metode izravne parazitološke dijagnostike

-     Metode neizravne parazitološke dijagnostike - SEROLOŠKE PRETRAGE - za dokaz protutijela na parazitarne antigene u serumu bolesnika

 

MIKOLOŠKE PRETRAGE

-     Metode izravne mikološke dijagnostike

-     Metode neizravne mikološke dijagnostike - SEROLOŠKE PRETRAGE - za dokaz protutijela na gljivične antigene u serumu bolesnika

Pogledati Upute za uzimanje i slanje uzoraka o pravilnom uzimanju i slanju uzoraka kliničkog materijala!


BAKTERIOŠKE PRETRAGE

1.   Metode izravne bakteriološke dijagnostike

a) Izolacija i identifikacija patogenih bakterija i mikobakterija

   -   iz uzoraka stolice

   -   iz uzoraka dišnog sustava

   -   iz uzoraka spolnomokraćnog sustava

   -   iz uzoraka aspirata, punktata, rana i dr.

   -   pleuralni punktat, različiti drugi bioptati
 

Ukoliko se sumnja na bakterije koje se  rjeđe pojavljuju kao uzročnici infetivnih stanja, kao što su Listeria, Clostridium, Bordetella, Mycoplasma pneumoniae, Corynebacterium diphteriae, Bacillus antracis, Neisseria meningitidis,Vibrio cholerae, Legionella pneumophilla i druge, molimo da se posebno naznači na uputnici.

b)  Dokaz antigena patogenih vrsta bakterija imunodijagnostičkim pretragama (npr. detekcija antigena Chlamydia trachomatis i Legionella pneumophilla imunoenzimskim testom u uzorcima različitih kliničkih materijala)
 

c)  Dokaz nukleinskih kiselina PCR-metodom

    -  Chlamydia trachomatis

    -  Chlamydia pneumoniae

    -  Mycoplasma pneumoniae

    -  Legionella pneumophilla

    -  Neisseria meningitidis (A, B, C, Y, W135)

    -  Neisseria gonorrhoeae

    -  Ureaplasma spp.

    -  Mycoplasma spp.

    -  Borrelia burgdorferi

    -  Leptospira interrogans (14 serovara)

 

d)  Ispitivanje osjetljivosti bakterijskih izolata na antibiotike difuzijskom metodom (antibiogram)

e)  Bakteriološka obrada uzoraka različitih materijala u cilju nadzora nad bolničkim infekcijama

                     - uzorci vode za hemodijalizu

                     - uzorci dijalizata

                   - uzorci nežive okoline (obrisci površina i medicinskih pomagala)

                   - uzorci uzeti osoblju u jedinicama intenzivne njege i operacijskim jedinicama

                     (npr. obrisci ruku, ždrijela, nosa, nazofarinksa, aksila)
 

f)  Kontrola postupka sterilizacije provedenog suhim sterilizatorom i autoklavom

2.   Metode neizravne bakteriološke dijagnostike - SEROLOŠKE PRETRAGE - za dokaz protutijela na bakterijske antigene u serumu bolesnika

Beta-hemolitički streptokoki:

   - AST-O - Antistreptolizinski titar  (IH, TBM)

   - ADNB - Antistrepto-DN-aza B  (ND)

   - ASK – Antistreptokinaza  (AG)

Staphylococcus aureus:

   - ASTA - Antistafilolizinski titar (latex- AG)

Bartonella henselae/quintana (IFA)

Bordetella pertussis (EIA)

Borrelia burgdorferi (Lyme) (IHA, IFA, EIA, WB)

Francisella tularensis (tularemija) (AG)

Haemophilus influenzae (IFA)

Klebsiella pneumoniae (IFA)

Legionella pneumophila (IFA, EIA)

Leptospira interrogans (AG-LY, EIA)

Sifilis, lues:

   -  VDRL (RPR)

   -  Treponema pallidum (TPHA, FTA-ABS, EIA, WB)

- salmonelozu (AG - aglutinacija po Widalu)

- brucelozu (AG – aglutinacija po Wrightu)

- šigelozu (AG)

- jersinije (AG)

- Helicobacter pylori   (EIA IgA i IgG)

- Mycoplasma pneumoniae  (RVK, HA, EIA)

- Chlamydia pneumoniae (RVK, MIF)

- Chlamydia psittaci (RVK, MIF)

- Chlamydia trachomatis (RVK, MIF)

- Rikettsia prowazeki (epidemični tifus) (RVK, WF)

Rikettsia typhi (murini tifus) (RVK, WF)

- Rikettsia conorii (mediteranska groznica) (RVK, WF)

 

Legenda:

RVK - reakcija vezanja komplementa

MIF - mikrofluorescentni test

EIAenzimski imuno test

WF – Weill Felix test

AG – aglutinacija

AG-LY- aglutinacija liza

IFAindirektni imunofluorescentni test

WBWestern blott

IHAindirektna hemaglutinacija

HAhladna aglutinacija

TPHATreponema pallidum hemaglutinacija            

FTA-ABS – test fluorescentnih antitijela na treponemu uz apsorpciju

RPR - rapid plazma reagin (odgovara VDRL testu)

IH - inhibicija hemolize

TBM - turbidimetrija

Lateks- AG - lateks aglutinacija

 3.  Serološke pretrage za dokaz reumatoidnih stanja i autoimunih bolesti

- AST-O

- ADNB

- ASK

- ASTA

- CRP - C reaktivni protein (TBM)

- Lateks RF - Lateks reuma faktor (anti IgG)  (TBM, PLT)

- WR - Waaler-Rose test (anti IgG) (IHA)

- ANF (ANA) - Antinuklearni faktor (IFA)

- ENA screen - Antitijela na ekstrahirani nuklearni antigen (nRNP/Sm, Sm, SS-A/Ro, SS-B/La, Scl-70, Jo-1, ds-DNA, histoni, ribosomalni P-proteini, centromere) (EIA)  

- ENA profil (nRNP/Sm, Sm, SS-A, SS-B, Scl-70, Jo-1, histoni, ribosomalni P-proteini, centromere)  (EIA)

- ADNA (Anti-ds-DNA) - Antitijela na dvolančanu DNA - (IFA, EIA)

- c-ANCA (PR3) - klasična antineutrofilna citoplazmatska antitijela (EIA)

- p-ANCA (MPO) - perinuklearna antineutrofilna citoplazmatska antitijela (EIA)

 


VIROLOŠKE PRETRAGE

1.  Metode izravne virološke dijagnostike 

a) Izolacija virusa iz raznih kliničkih materijala  

-   virus krpeljnog encefalitisa

-   POLIO  I, II, III virus

-   ECHO virus

-   Coxsackie virus

-   HSV (Herpes simplex ) 1, 2

-   Adenovirusi (18 tipova)

-   Rhino virusi

-   Influenca A, B virus

-   Parainfluenca 1,2,3 virus

-   Virus parotitisa

-   Virus morbila

-   RSV (respiratirni sincicijalni virus )

-   Cytomegalovirus

-   SARS-COV (Corona virusi)

 

b) Dokaz antigena imuno testovima u kliničkom materijalu

-   Norwalk-like virusi, Astrovirusi, Rota virusi, Hepatitis A i adenovirusi u stolici

-   Influenca A i B virus, parainfluenca 1, 2 i 3 virus, adeno virusi, RSV, HSV 1 i 2 u uzorcima respiratornog trakta

-   Virus parotitisa u obrisku ždrijela

 

c) Dijagnostika virusa u pitkoj i otpadnoj vodi (Polio virus, Echo virus, Coxackie virus, Hepatitis A virus, Rota virus)
 

d) Dokaz nukleinskih kiselina PCR-metodom

-   Influenza virus tip A

-   Influenza virus podtip A/H1, A/H3, A/H5, A/H1N1

-   Influenca virus tip B

-   Virus parotitisa  

-   Virus morbila

-   RSV tip A

-   RSV tip B

-   hMPV

-   CMV

-   Enterovirusi

-   Hepatitis A virus

-   Virus rubele

-   Virus krpeljnog meningoencefalitisa (KME, TBEV)

-   Virus dengue

2.   Metode neizravne virološke dijagnostike - SEROLOŠKE PRETRAGE - za dokaz protutijela na virusne antigene u serumu bolesnika 

- Virus krpeljnog encefalitisa (RVK, EIA)

- Virus limfocitnog koriomeningitisa (RVK)

- Polio virus 1-3 (RVK)

- ECHO virusi (RVK)

- Coxsackie virusi (RVK)

- Rota virusi (RVK)

- Virus parotitisa (RVK, IFA)

- Herpes virus 1, 2 (RVK, EIA, WB)

- Adenovirusi (RVK)

- Virus influence A, B (RVK, HI)

- Virus parainfluence (RVK)

- Respiratorni sincicijalni virus (RVK)

- Virus morbila (RVK, EIA, IFA)

- Virus rubele (RVK, EIA, HI, AV)

- Varicella zoster virus (RVK, EIA, AV)

- Cytomegalovirus (RVK, EIA, AV)

- Epstein-Barr virus (RVK, EIA, IFA, PBD)

- HGBS virus (hemoragijska groznica s bubrežnim sindromom) (EIA, IFA)

- SARS-COV (Corona virus) (ICHG)

 

Legenda:

RVK – reakcija vezanja komplementa

EIA – imunoenzimski test

HI – ihibicija hemaglutinacije

IFA – indirektni imunofluorescentni test

AV – test avidnosti

Wb – Western blot

PBD – Baul-Bunnel-Davidsohn test

ICHG-imunokromatografski test

 


PARAZITOLOŠKE PRETRAGE

1.  Metode izravne parazitološke dijagnostike

a) Dokaz parazitarnih elemenata u kliničkim uzorcima

- stolica na ciste protozoa  i jaja helminata (nativni preparat, metode koncentracije, koprokultura)

- stolica na kokcidije (Cryptosporidium, Cyclospora, Isospora) metode bojenja, autofluorescenca

- perianalni otisak na Enterobius

- brisevi genitalnog trakta žena, ejakulat, urin, bris uretre muškarca na Trichomonas vaginalis (nativni preparat, kultivacija, PCR)

- bioptati i punktati organa na tkivne parazite (nativno, metode bojenja, histološki preparat)

- detekcija parazita u tjelesnim tekućinama i sekretima (nativno, metode bojenja, histološki preparat, miracidijski test)

- krvni razmaz i gusta kap na parazite Plasmodium falciparum, vivax, ovale, malariae, knowlesi, Babesia, Trypanosoma brucei, Trypanosoma cruzi, mikrofilarije

- kultivacija  protozoa (Leishmania, Trihomonas, Entamoeba histolytica, slobodno živuće amebe - Acanthamoeba spp, Naegleria fowleri, Balamuthia mandrilaris)

- makroskopska i mikroskopska determinacija helminata i artropoda

 

b) Dokaz antigena parazita

 - Entamoeba histolytica u stolici (EIA)

 - Cryptosporidium sp. u stolici (EIA)

-  Giardia lamblia (EIA)

-  Plasmodium falciparum (IC)

 

c) Dokaz nukleinskih kiselina PCR metodom

 - Trichomonas vaginalis

 - Toxoplasma gondii

-  Leishmania sp.

-  Acanthamoeba

2.   Metode neizravne parazitološke dijagnostike - SEROLOŠKE PRETRAGE - za dokaz protutijela na parazitarne antigene u serumu bolesnika na:

- toksoplazmozu (ELFA IgM, IgG, EIA IgA; ELFA AV IgG, ISAGA IgM, IgA IGg, WB komparativni IgG-IgM)

- ehinokokozu (EIA, RVK, WB)

- cisticerkozu - Taenia solium (EIA, WB)

- lišmaniozu (IFA, EIA, WB)

- malariju (IFA)

- toksokarozu (EIA, WB)

- trihinelozu (EIA, WB)

- amebijazu (IFA, EIA)

- strongiloidozu (EIA)

- askariozu (EIA)

- fasciolozu (EIA; WB)

 

Legenda:

IFA -  indirektni imunofluorescentni test

IC - imunokromatografski test

EIA - imunoenzimski test

ELFA- enzimsko fluorescentni test

ISAGA - imunosorbentni test

AV IgG - test avidnosti IgG protutijela (razlikovanje svježe i starije infekcije)

WB - Western blot


MIKOLOŠKE PRETRAGE

1.  Metode izravne mikološke dijagnostike

a)  Dokaz  antigena patogenih vrsta kvasaca imunodijagnostičkim pretragama (npr. dokaz kapsularnog antigena vrste Cryptococcus neoformans u uzorcima tjelesnih tekućina metodom lateks aglutinacije – LA)

b)  Izolacija i identifikacija gljiva (kvasaca i plijesni) iz uzoraka različitih kliničkih materijala

c)  Ispitivanje osjetljivosti izolata kvasaca na antimikotike difuzijskom metodom (E-test)

d)  Tipizacija kliničkih izolata kvasaca (biotipizacija i kemotipizacija)

e)  Identifikacija gljivičnih sojeva (kvasaca i plijesni) izoliranih u drugim mikrobiološkim laboratorijima

f)  Dokaz nukleinskih kis. PCR-metodom

    -  Pneumocystis jiroveci

 

2.   Metode neizravne mikološke dijagnostike – SEROLOŠKE PRETRAGE za dokaz protutijela na gljivične antigene u serumu bolesnika

 

- serološke pretrage na sustavnu kandidozu  (IHA; AG, IFA, PIE)

- serološke pretrage na sustavnu aspergilozu (IHA, PIE)

- serološke pretrage na sustavnu kriptokokozu (AG, IFA)

 

Legenda:

IHA- indirektna aglutinacija

IFA – indirektna imunofluorescenca

PIE - protusmjerna imunoelektroforeza

Agl.- aglutinacija u epruveti

LA- lateks aglutinacija

 


 

Posljednja promjena - 14.01.2013. - Last change