U Hrvatskoj su na snazi mjere sprečavanja unosa virusa ebole u zemlju. Epidemiološka situacija u zemlji i svijetu pomno se nadzire, a zdravstveni sustav povezan je sa službenim međunarodnim sustavima ranog uzbunjivanja. Iako broj oboljelih u zemljama zapadne Afrike u ovoj epidemiji ebole raste, rizik pojave epidemije u Hrvatskoj je i dalje nizak.
Danas je u jednoj zagrebačkoj bolnici izvršeno epidemiološko ispitivanje jednog dojavljenog slučaja u pacijenta s vrućicom i nespecifičnim simptomima zarazne bolesti. Budući da ta osoba nije putovala u zemlje zahvaćene epidemijom ebole niti ima zadovoljen neki drugi epidemiološki kriterij potreban da bi se uopće postavila sumnja na ebolu, na temelju epidemiološkog ispitivanja isključena je mogućnost zaraze virusom ebole, a pacijentu se pruža adekvatna dijagnostička obrada i liječenje.